Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms