Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
OC90Q02509 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OC90Q02509 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms