Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 478.7 ms