Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSF1Q00613 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms