Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMF1P82094 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMF1P82094 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms