Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIM1P81133 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms