Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL7P80098 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL7P80098 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL7P80098 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms