Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms