Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms