Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF4A1P60842 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A1P60842 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms