Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN17P56750 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms