Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAG2P55895 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAG2P55895 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms