Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC13P55735 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC13P55735 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC13P55735 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC13P55735 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC13P55735 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC13P55735 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC13P55735 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC13P55735 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC13P55735 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC13P55735 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC13P55735 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms