Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRPF1P55201 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms