Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PGGT1BP53609 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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PGGT1BP53609 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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