Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA4P51532 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms