Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERFP50548 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERFP50548 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERFP50548 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERFP50548 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms