Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTPAP49638 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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