Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RANGAP1P46060 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RANGAP1P46060 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms