Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms