Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-1P43699 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-1P43699 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms