Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRATP43155 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRATP43155 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRATP43155 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRATP43155 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRATP43155 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CRATP43155 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRATP43155 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRATP43155 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRATP43155 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms