Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER2P43116 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER2P43116 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms