Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5CP41229 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms