Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM6P40199 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms