Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNCAP37840 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms