Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBRP36941 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms