Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms