Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYKP34925 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYKP34925 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYKP34925 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms