Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA13P31271 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms