Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms