Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXP28300 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXP28300 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms