Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms