Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGA3P26006 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms