Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF4P23510 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms