Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRGP23470 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
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