Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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