Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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