Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms