Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms