Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRF1P14222 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRF1P14222 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms