Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD8P13378 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms