Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms