Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ODC1P11926 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODC1P11926 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODC1P11926 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ODC1P11926 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms