Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms