Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00032P0C843 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms