Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VIL1P09327 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIL1P09327 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIL1P09327 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIL1P09327 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms