Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP10P09238 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP10P09238 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms