Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms