Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms